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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
县城医院见闻：扩大病区 全力接诊******
(新春走基层)县城医院见闻：扩大病区 全力接诊
中新网长治1月11日电 题：县城医院见闻：扩大病区 全力接诊
作者 杨静 张月
“感觉怎么样？还有哪些地方不舒服？”山西省长治市长子县人民医院，心血管内科主任赵伟平正在病床前耐心询问患者病情，叮嘱护士和家属护理重点。
11日，走进长子县人民医院，记者看到，医护人员在各自岗位忙碌着，一个医生面对好几个患者。护士站内，负责分诊的护士忙着回答患者的提问；各个病区内，医护人员坚守岗位，排痰、配药、输液……为患者做好服务。
随着疫情防控措施的优化调整，长子县人民医院接诊患者人数持续处于高位。针对当前病患持续增多的情况，该医院进一步筹措医疗资源，统筹调配病房床位，全力兜住医疗救治和生命保障底线。
急诊科副主任柴科介绍，近日，120接诊人次由原先的每天6车至8车次增加到每天20多车次，院内急诊人数由原先的30人至40人次，增加到每天80人次。“就诊患者主要为有基础疾病的老年人，病情较重，多数需要住院治疗。”
“对于需要住院的患者，重症、危重症收到重症医学科(ICU)、感染科，轻型、普通型收到呼吸内科、内分泌科等科室，医院对患者做到应收尽收。”柴科说。
长子县人民医院全员动员、克服困难、坚守岗位，立志当好民众身体健康和生命安全的“守门人”。 长子县融媒体中心提供长子县人民医院重症医学科主要承担收治新冠危重症患者的艰巨任务。在该科室，记者看到，呼吸机、监护仪、排痰仪等医疗设备保障到位，医护人员有条不紊地开展着各项救治工作。
“由于大部分患者是合并基础病多的老年人，这更要求我们医护人员提起精神来对症治疗、精心护理。”重症医学科护士长张秀丽说，医护人员几乎都是白天黑夜连轴转。
目前，长子县人民医院重症医学科开放床位6张，在使用床位12张，自2022年12月7日以来，共接收新冠危重症患者26人，已治愈出院12人。
医务科副主任常丽丽告诉记者，针对目前当地住院患者增多的情况，长子县人民医院合理整合利用内科系统床位，同时整合妇科、眼耳鼻喉科、口腔科、骨科、外科等外科系统床位，实行“全院一张床”管理模式。“床位实行统一调度，除预留部分疾病危急重症床位外，其余床位均用于收治新冠患者。”
当前，长子县人民医院共收治新冠患者约280人，感染科、大内科作为收治新冠患者的主阵地，承担主要救治任务。心血管内科、神经内科、内分泌科、中医康复科等内科系统科室统筹调度，同步接收新冠患者。
“目前，所有医师均参与到新冠患者的诊疗救治工作中。”常丽丽说。在这场没有硝烟的战场上，长子县人民医院全员动员、克服困难、坚守岗位，立志当好民众身体健康和生命安全的“守门人”，让民众在家门口有“医靠”。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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